Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BHMTQ93088 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms