Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2Q92932 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRN2Q92932 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms