Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NEO1Q92859 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NEO1Q92859 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms