Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SEMA4DQ92854 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEMA4DQ92854 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA4DQ92854 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms