Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
P3H4Q92791 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms