Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3AQ92664 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3AQ92664 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3AQ92664 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms