Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DNAAF4Q8WXU2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DNAAF4Q8WXU2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNAAF4Q8WXU2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms