Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RUFY2Q8WXA3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY2Q8WXA3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms