Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE1Q8WV22 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE1Q8WV22 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms