Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB2BQ8WUD1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB2BQ8WUD1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms