Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBASH3BQ8TF42 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBASH3BQ8TF42 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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