Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSH3Q8TE77 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH3Q8TE77 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms