Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAT3Q8TDW7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FAT3Q8TDW7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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