Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMO3Q8TAP4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMO3Q8TAP4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms