Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM46DQ8NEK8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM46DQ8NEK8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms