Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF548Q8NEK5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF548Q8NEK5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms