Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG7

DENND6B, Protein DENND6B, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND6BQ8NEG7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND6BQ8NEG7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DENND6BQ8NEG7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms