Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNNM3Q8NE01 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNNM3Q8NE01 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNNM3Q8NE01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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