Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35BQ8NCS4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms