Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AVL9Q8NBF6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms