Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTC29Q8NA56 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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