Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC9Q8N567 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC9Q8N567 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZCCHC9Q8N567 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms