Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVBPQ8N300 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms