Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D3Q8IZS8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA2D3Q8IZS8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms