Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLX4Q8IY92 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLX4Q8IY92 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLX4Q8IY92 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms