Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM42Q8IWZ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM42Q8IWZ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms