Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNL1Q8IU54 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNL1Q8IU54 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNL1Q8IU54 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms