Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKAP1Q86WV1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SKAP1Q86WV1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms