Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RPAINQ86UA6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms