Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLNKQ7Z7G1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLNKQ7Z7G1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms