Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMUB2Q71RG4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMUB2Q71RG4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms