Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA0408Q6ZU52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIAA0408Q6ZU52 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIAA0408Q6ZU52 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIAA0408Q6ZU52 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA0408Q6ZU52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA0408Q6ZU52 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms