Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFLNAQ6ZTI6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFLNAQ6ZTI6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms