Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf47Q6ZRZ4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms