Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNI2Q6ZMN8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms