Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L3Q6VB84 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXD4L3Q6VB84 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms