Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALKAL1Q6UXT8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALKAL1Q6UXT8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms