Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP12Q6UXS9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP12Q6UXS9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms