Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCBE1Q6UXH8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms