Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCIMPQ6UWF3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCIMPQ6UWF3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms