Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A10Q6U841 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC4A10Q6U841 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms