Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC137Q6PK04 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms