Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRAT1Q6PJG6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRAT1Q6PJG6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms