Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC23A3Q6PIS1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC23A3Q6PIS1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC23A3Q6PIS1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms