Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C22orf39Q6P5X5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms