Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNCKQ6P2M8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNCKQ6P2M8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNCKQ6P2M8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNCKQ6P2M8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNCKQ6P2M8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNCKQ6P2M8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNCKQ6P2M8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms