Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KANK3Q6NY19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KANK3Q6NY19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KANK3Q6NY19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms