Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPH2Q6IBW4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCAPH2Q6IBW4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms