Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms