Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPECC1LQ69YQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms